Proteinförändringar genom åldrandet
Kartläggning av proteinförändringar genom åldrandet
Med den globala befolkningens åldrande i en aldrig tidigare skådad hastighet har förebyggande av åldersrelaterade sjukdomar blivit en framträdande fråga. Det är viktigt att heltäckande och kvantitativt utvärdera de förändringar som åldrandet orsakar på molekylär nivå i kroppen.
Genom att göra det kan det vara möjligt att peka ut specifika åldrande-faktorer och undertrycka åldersrelaterade sjukdomar.
För att ta itu med detta problem, etablerade tidigare utförd forskning en karta över förändringar i viktiga vävnader från åldrandet genom att bestämma i vilken utsträckning mRNA producerades i levande celler. Det har dock inte funnits en karta över förändringar i proteiner i samband med åldrande. För att fylla denna lucka i forskningen byggde ett team under ledning av lektor Masaki Takasugi och professor Naoko Ohtani vid Osaka Metropolitan Universitys Graduate School of Medicine en mycket omfattande databas kallad Mouse Aging Proteomic Atlas.
De gjorde det genom att analysera proteomerna och transkriptomerna från hjärna, artär, hjärta, njure, lever, lunga, skelettmuskulatur och hudvävnader från 6-, 15-, 24- och 30 månader gamla möss, såväl som extracellulära möss, matrisberikade fraktioner av större vävnader.
Genom detta blev det möjligt att analysera egenskaperna hos proteingrupper som påverkas av åldrande i större vävnader och avslöjade proteiner i den extracellulära matrisen som ökade med åldern.
"Genom att förtydliga förändringarna i olika vävnader på grund av åldrande i detalj med avseende på antalet proteiner som är direkt kopplade till genfunktion, har vi dramatiskt förbättrat vår förståelse av de övergripande förändringarna på molekylär nivå", säger Dr. Takasugi.
Professor Ohtani avslutade, "Resultaten av denna forskning förväntas bidra till en bättre förståelse av de förändringar som sker med åldrandet."
Abstrakt
En karta över det åldrande musproteomet avslöjar egenskaperna hos åldersrelaterad post-transkriptionell dysreglering.
I vilken utsträckning och hur post-transkriptionell dysreglering påverkar åldrande proteom är fortfarande oklart.
Här tillhandahåller vi proteomiska data för helvävnadslysat (WLT) och proteinberikade fraktioner med låg löslighet (LSF) av större vävnader insamlade från möss på 6, 15, 24 och 30 månader gamla.
Låglösliga proteiner påverkas företrädesvis av ålder och analysen av LSF fördubblar antalet proteiner som identifieras vara differentiellt uttryckta med åldern. Samtidig analys av proteom och transktiptom med användning av samma vävnadshomogenat avslöjar egenskaperna hos åldersrelaterad post-transkriptionell dysreglering.
Post-transkriptionell dysreglering blir uppenbar särskilt efter 24 månaders ålder och åldersrelaterad post-transkriptionell dysreglering leder till ackumulering av kärnmatris som proteiner och minskning av mitokondriella membranproteiner i flera vävnader.
Baserat på våra djupgående proteomiska data och provmatchande transkriptomdata från vuxna, medelålders, gamla och geriatriska möss, konstruerar vi Mouse Aging Proteomic Atlas, som ger en grundlig och integrerande bild av åldersrelaterade genuttrycksförändringar.
Kommentarer
Skicka en kommentar